Por medio del programa de Equipamiento Conjunto el CDCHTA cofinancia hasta el 50% de cada solicitud para la compra de equipos para las Unidades de Investigación, mientras que el resto será aportado por las facultades y núcleos de adscripción del investigador responsable. Los equipos adquiridos pertenecerán al Laboratorio, Grupo, Centro o Instituto donde prestarán servicios y tendrán el fin para el cual fueron solicitados, siendo el responsable del uso y mantenimiento de los mismos el Jefe de la Unidad de Investigación.
De acuerdo con las Subvenciones para equipamiento institucional plasmadas en la Normativa del CDCHTA, cuando existan deficiencias en el equipamiento de la Unidad de Trabajo donde realizan sus investigaciones, un grupo de tres o más profesores podrá solicitar financiamiento o cofinanciamiento. Los equipos adquiridos con fondos del CDCHTA quedarán bajo la custodia y responsabilidad del jefe de la Unidad de Trabajo que los haya solicitado, hasta tanto sean útiles a los fines para los cuales fueron adquiridos. Si la necesidad de ellos en la Unidad de Trabajo cesara, el CDCHTA podrá cederlos en préstamo, bajo custodia a cualquier otra Unidad de Trabajo donde se les requiera.